В університеті на громадських засадах налагоджено діяльність наукових підрозділів:
Регіональний комплексний науково-методичний центр інноваційних технологій
Директор центру – д-р пед. наук, проф. О.Б. Петренко.
Освітньо-ресурсний центр
Керівник центру – д-р пед. наук, проф. Р.Л. Сойчук.
До складу Освітньо-ресурсного центру входять:
Центр професійного розвитку педагога
Керівник – канд. пед. наук, доц. Третяк О.М.
Центр Європейської педагогічної освіти
Керівник – канд. пед. наук, доц. Синьчук О.М.
Науково-методичний Центр інклюзивної освіти
Керівник – канд. пед. наук, доц. Бричок С.Б.
Центр гуманітарних досліджень
Науковий керівник – канд. філол. наук, доц. Н.В. Шульжук.
Лабораторія консалтингу дошкільної освіти
Науковий керівник – д-р пед. наук, проф. І.М. Дичківська
Науково-дослідна лабораторія кафедри інформатики та прикладної математики «Математичне моделювання нелінійних збурень процесів та систем»
Науковий керівник – канд. фіз.-мат. наук, доц. І. П. Мороз.
Науково-методичний інноваційний центр підвищення якості професійно-педагогічної підготовки майбутніх фахівців
Науковий керівник – д-р пед. наук, проф. С. В. Лісова.
Центр міждисциплінарних досліджень з питань науки, релігії, культури (спільно з Рівненською Єпархією ПЦУ )
Науковий керівник – д-р філос. наук, проф. І.І. Панчук.
Навчально-наукова лабораторія «Міжкультурна комунікація у професійній підготовці майбутнього вчителя іноземної мови та зарубіжної літератури»
Науковий керівник – д-р пед. наук, проф. О. В. Безкоровайна.